基因療法新拼圖：算法揭示188種新型CRISPR系統

基因療法新拼圖：算法揭示188種新型CRISPR系統

IT之家 11 月 25 日消息，科學家近日開發出新算法，在數十億個蛋白質序列中，成功發現 188 個罕見且以前未知的 CRISPR 連接基因模塊，為利用 CRISPR 系統和了解微生物蛋白質的功能多樣性提供了新見解。

圖源：Carlos Clarivan / Science Photo Library

該項目由 CRISPR 技術先驅張鋒教授帶領，團隊成員來自麻省理工學院麥戈文腦研究所、麻省理工學院和哈佛大學布羅德研究所以及美國國立衛生研究院國家生物技術信息中心（NCBI）等，相關成果于 11 月 23 日發表在《Science》期刊上。

團隊開發出新的搜索算法基于快速局部敏感哈希聚類算法（FLSHclust），使用該算法深入挖掘三個主要的公共數據庫，從中識別出了 188 種新型 CRISPR 系統，并對其中 4 個系統進行了詳細表征。

這些新系統可能被用來編輯哺乳動物細胞，其脫靶效應比目前的 CRISPRCas9 系統要少，也有可能在被用于診斷或用來記錄細胞內部活動。

該研究發現了幾種已知 I 型 CRISPR 系統的新變體，未來能被用于開發更精準的基因編輯技術。

此外，研究人員還發現了一些 IV 型 CRISPR 系統的新的作用機制，以及精確靶向 RNA 的 VII 型系統（有可能被用于 RNA 編輯）。研究人員表示，該研究突出了 CRISPR 系統前所未有的多樣性和靈活性。

IT之家附上論文參考地址：Han AltaeTran et al.,Uncovering the functional persity of rare CRISPRCas systems with deep terascale clustering.Science382,eadi1910(2023).DOI:10.1126/science.adi1910