我國(guó)科學(xué)家研發(fā)高穩(wěn)健蛋白質(zhì)組分析系統(tǒng)，可診斷早期胃癌標(biāo)志物

我國(guó)科學(xué)家研發(fā)高穩(wěn)健蛋白質(zhì)組分析系統(tǒng)，可診斷早期胃癌標(biāo)志物

IT之家 12 月 23 日消息，中國(guó)科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所近日發(fā)布公告，宣布開(kāi)發(fā)出一種位點(diǎn)特異性糖型的高穩(wěn)健蛋白質(zhì)組分析系統(tǒng)，可以診斷早期胃癌標(biāo)志物。

該項(xiàng)目由該研究所生物技術(shù)研究部生物分離分析新材料與新技術(shù)研究組（1809 組）葉明亮研究員團(tuán)隊(duì)和空軍軍醫(yī)大學(xué)聶勇戰(zhàn)教授團(tuán)隊(duì)等合作開(kāi)發(fā)，規(guī)模化分析 278 例臨床樣本進(jìn)行 N糖基化蛋白質(zhì)組，篩選并驗(yàn)證了新型蛋白質(zhì)糖基化類生物標(biāo)志物，可用于診斷胃癌尤其是早期胃癌。

目前在臨床上使用的腫瘤標(biāo)志物基本上都是糖蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)糖基化的異常與疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)，但是還沒(méi)有在特定蛋白質(zhì)、特定位點(diǎn)上的特定糖型（即位點(diǎn)特異性糖型）的疾病標(biāo)志物。

研究人員開(kāi)發(fā)出了一個(gè)高穩(wěn)健的位點(diǎn)特異性糖型蛋白質(zhì)組學(xué)分析系統(tǒng)。該系統(tǒng)采用自動(dòng)化方法富集生物樣本中的 N完整糖肽，然后采用微流 LCMS / MS 系統(tǒng)檢測(cè) N完整糖肽，并利用團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的 GlycoDecipher 軟件鑒定和定量位點(diǎn)特異性糖型。

科研人員使用該系統(tǒng)分析了 200 多個(gè)樣品，發(fā)現(xiàn)其富集特異性保持在 88.1% 到 91.7% 之間，展現(xiàn)了穩(wěn)定的糖肽富集性能。

在 10 個(gè)批內(nèi) / 批間的質(zhì)量控制樣本中，N完整糖肽、糖基化位點(diǎn)和糖蛋白的鑒定數(shù)目的相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差均低于 7%，并且定量 N完整糖肽的 Pearson 相關(guān)系數(shù)平均值為 0.909。

經(jīng)過(guò)長(zhǎng)時(shí)間分析超過(guò) 200 份大隊(duì)列樣本后發(fā)現(xiàn)，每個(gè)質(zhì)量控制樣本依然能穩(wěn)定地鑒定到平均 1900 條完整的 N完整糖肽。

因此，該系統(tǒng)具有高靈敏、高穩(wěn)健的 N完整糖肽鑒定性能，為 N糖基化位點(diǎn)特異性糖型的規(guī)模化分析提供了一個(gè)有力的分析工具。

IT之家附上論文參考地址如下：https://doi.org/10.1002/advs.202306955。